1、需要袋装料的蘑菇，比如平菇，杏鲍菇之类的，将菌棒插入袋中即可，需要在超净工作台操作接种，每个袋子五至六根即可。
2、菌床栽培的蘑菇，比如双孢菇之类的，将菌棒按照一定的排列和间隔均匀插入菌床即可。一般情况下，大规模生产才会使用菌棒，操作简单，但是制作比较麻烦，发菌也比较慢，多配合其他类型菌种使用。
