淘宝店铺被扣48分不交6000块罚款有影响的，首先是不交罚款店铺无法继续经营而且店铺里面的保证金由于有罚款无法退出，其次店铺被罚款后如果逾期不交的话会产生滞纳金，如果金额过大的话还可能会被平台起诉违约要求支付罚金。
