4S店包上牌,车主也是不可以拿回车辆合格证的。这是因为车辆办理注册登记入户上牌照手续时,必须要提交车辆合格证的,否则,车辆无法入户。而车辆合格证在注册登记入户手续完成后,由车辆管理部门收起,存放在车辆档案里的。所以说,车主不可以取回的。