珊瑚的各种各样的颜色与其共生的藻类有关，例如：虫黄藻。当珊瑚体内的共生藻数量下降时，会造成珊瑚白化的现象。
所以，珊瑚骨本身的颜色常呈白色，也有少量蓝色和黑色。宝石级珊瑚为红色、粉红色、橙红色。红色的珊瑚是由于在其生长过程中要吸收海水中1%左右的氧化铁，黑色的珊瑚是由于其含有有机质所导致。
珊瑚的表面拥有缤纷色彩的能够调节光线的荧光色素，对珊瑚共生海藻的影响以及对珊瑚适应明暗不同的环境有重要作用。
为什么珊瑚有各种各样的颜色
珊瑚有多种颜色，不过最长见得是白色，如果珊瑚没有虫黄藻就会呈现白色，如果珊瑚受到打扰就会排出虫黄藻，也会变成白色，这叫珊瑚白化，另外珊瑚死掉之后，虫黄藻也会死，之后就会变白，所以我们看到的珊瑚标本一般都是白色的。
红色珊瑚是因为虫黄藻吸收太多的氧化铁造成的，其中世界上最珍贵的珊瑚就是红色的。
呈现黑色是由于有机质含量太丰富，此外还有少量的蓝色珊瑚，这也是与吸收的物质有关，无论是哪种颜色的珊瑚，在环境方面作用都是独一无二的。
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