葱根蛆北方1年发生3～4代，以蛹在土中越冬。早春成虫开始大量出现，并产卵在根部附近湿润土层，卵孵化后顺葱白向下移动，集中蛀食茎盘，使根部腐烂、叶片发黄、植株枯死。
葱蝇各世代中都有一部分蛹滞育后经越冬而集中在春季羽化，所以，葱蝇一般在春季为害重，夏季较轻，秋季也有发生。
