看实际情况。
如果是全新安装系统,删除所有分区,再重新分区,那么4K对齐之后文件肯定是全丢的。其实导致文件全丢的并不是4K对齐,而是分区。如果只是删除系统分区,那么除了系统分区文件全丢之外,其他分区文件是毫发无损的,不会丢失的。