1、所培养的人才不同。
军事院校指挥类专业主要是为军队培养基层指挥军官。
军事院校非指挥类专业也称为技术专业，主要为军队培养初级专业技术人员，比如军医、军械、通信等专业。
2、专业要求不同。
指挥类专业对学员在身体素质、个人气质、文化基础、政治素养方面都有较高的要求。主要是为了培养平时能管理、战时能指挥的军官。这些初级军官不仅要了解基本武器和装备的使用，还有了解怎么带兵，怎么管理，怎么组织和指挥。所以，军队指挥专业要求这些学员：强健的体魄，良好的耐心，较强的责任心，和优秀的指挥才能。
非指挥类专业对学员的文化基础要求都比较高，要具有扎实的知识基础，和较强的科研能力。
