主水箱和副水箱相通，摩托车冷却系统中的副水箱主要起平衡冷却系统压力的作用，与此同时它还会起到一个补水的作用。
通常情况下车辆初次启动时，副水箱的冷却液就会被吸入主水箱，用于发动机的冷却散热，而当整个冷却系统压力过高时，主水箱中的冷却液又会回流到副水箱，以减少主水箱的压力，根据这一特性摩托车副水箱内没有冷却液或者冷却液过多都是不正常的。
