pH梯度萃取法是分离酸性、碱性两种成分常用的手段。其原理是由于溶剂系统 pH变化改变了它们的存在状态（游离型或解离型），从而改变了它们在溶剂系统中的分配系数。
大体上有三类化合物使用上述方法做初步分离：蒽醌（例如：大黄）、黄酮（例如：槐角）和生物碱（例如：苦参）。
