1、水塔、水箱容积有限。水蓄满后深井泵需要停止运行，水位下降至水塔、水箱下限后深井泵需要重新起动。电动机频繁起停，大大缩短了水泵及电动机的使用寿命，设备运行维护成本较高。
2、水塔、水箱控制线路较长较高，检修不便。
3、水塔（高位水箱）初期建设成本相对较大，运行一定年限后需要维护大修，维修（维护）相当困难，且费用较高，同时设备占地面积较大。
4、使用压力上下限进行二次加压供水时管网水锤现象严重，对管网冲击很大，大大缩短管网使用寿命。
5、采用深井水泵取水、水塔水箱蓄水和二次加压的运行方式，系统设备相对较多，设备故障率高，能耗大，运行成本较高，同时饮用水存在二次污染现象。
6、压力上下限控制二次加压，用户水压波动范围较大，供水质量很差。
7、无塔上水器等设备电动机频繁起动，使用寿命短，电能损耗严重，运行噪声较大。
