广州21号线目前还没有与13号线的直接换乘站，21号线在员村站换乘5号线，坐往文冲方向的地铁，到达鱼珠站换乘13号线。
等13号线二期建成后，地铁21号线和13号线可以在天河公园站直接换乘，21号线是条多换乘的线路，在天河公园站可以换乘11号线，在黄村站可以换乘4号线。
