单位公积金没有清册也是可以减员的。根据住房公积金管理办法的相关规定,单位在当地公积金管理部门是由人员名单清册的,如果单位因管理原因,没有建立相关的公积金缴费人员清册,在公积金管理部门是有相关人员登记的,所以说单位在此情况下是可以进行减员业务的。