借阅函和调档函的区别在于，借阅函指的是用函件的形式，将资料或者是档案从档案馆借出来查看和阅览，比如，将酒泉市肃州区妇幼保健院有关资料借出阅览室查看。而调档函则指的是，用函件的形式从档案馆调出所需要查阅的档案资料进行查阅和利用。
