雅马哈46故障码是充电系统问题。这种故障万用表查整流器输入电压,电压低或者没电压就是磁电机故障,换线圈或者磁钢。摩托车充电系统担负着向电瓶充电和向全车供电的重任,充电系统发生故障后就容易充不进电导致电瓶亏电,严重时会影响到用电设备的正常使用,所以一旦发现电瓶亏电,就应及时对充电系统进行检查,重点检查磁电机和稳压整流器。