可以用水箱清洁剂清洗除垢。一般的清洗剂，无法彻底清除水道内的水垢和酸性物质，有时也能泡下来大片脱落的水垢，但这样会堵塞水道，有时要拆下水箱进行清洗。如果用质量好的强力清洗剂，水垢会呈现粉末状悬浮在冷却液中，不会堵塞发动机内的水道。所以选购水箱清洗剂时，千万不要只图便宜。
此外，要避免水垢的产生，就要注意水箱冷却液的选用。许多驾驶员不重视冷却液的使用及优劣，通常加入水箱的只是普通的水。
