两者的区别就在于它们各自所为的对象不一样。各自为阵：是自己守卫自己的阵地，不与其他阵地相关联的状态，自己打自己的仗为自己的阵地而努力，比如：现在下达命令，一团二团三团，你们各自为阵，消灭來敌各自为政：是一个群体建立和执行自己的主张规定和政策等，与其他的地方不一样，比如：现在有的单位各自为政，没有大局观念，一定要纠正这种不健康的现象。
各自为阵和各自为政的区别
各自为政指各自在职权范围内按照自己的主张行事不互相配合。比喻不考虑全局各搞一套。来自历史典故，多与职权、政权有关各自为营形容集体中互相不配合，互相不协作，各行其是不顾整体利益。两者为同义词，区别不是很大。
各自为阵和各自为政的区别
各自为政是成语，意为各自按自己的主张办事，不互相配合。比喻不考虑全局，各搞一套。其出处为《诗经·小雅·节南山》：“不自为政，卒劳百姓。”
在《左传·宣公二年》中：“畴昔之羊，子为政，今日之事，我为政。而各自为阵的意思，目前并不明确，大部分倾向于这是一个错误词语
