中医归食品药品管理局管理，现在机构改革，整合执法队伍，工商管理局、食品药品监督管理局、质量监督管理局3个单位合并为一个单位，统称为市场监督管理局，中医诊所的备案在市场监督管理局进行备案。要是进行备案的话，就到当地的市场监督管理局进行备案就可以了。
