水利部河湖保护中心为部直属公益一类事业单位（正局级），主要承担河湖水域及其岸线、河口保护，相关规划计划编制，以及河湖管理保护基础信息收集分析等技术性工作。
负责全国河湖等流域的保护管理工作。主要是水源、环境、流域的保护和管理。
