有区别,区别在于指向不同,概念不同,意义不同等,应诉是指应对,应付对自己的起诉,诉讼,是被告在法庭上出庭应对被诉讼的程序,而申诉是指申请,诉说,诉求,申辩有关部门的决定,决议的不公平的行为,是抗拒举动,所以二者指向不同,意思不同,区别很大