菏泽学院全国本科院校排名第669位，强于第670名的广东第二师范学院，第671名的铜仁学院，第672名的绵阳师范学院，第673名的山东女子学院，第674名的哈尔滨学院。在山东排第35名，强于第36名的山东女子学院，第37名的山东青年政治学院，第38名的潍坊科技学院，第39名的烟台南山学院，第40名的济宁学院。
