区别是色胺存在于哺乳动物大脑中，作为神经调节剂或神经递质发挥作用。与其他微量胺类似，色胺与人类微量胺相关受体1（TAAR1）作为激动剂结合。然而，五羟色胺在外周组织，作为一种强血管收缩剂和平滑肌收缩刺激剂。
在体内，五-羟色胺可以经单胺氧化酶催化成五-羟色醛以及五-羟吲哚乙酸而随尿液排出体外。
色胺和五羟色胺区别
色胺由色氨酸脱羧形成的胺。由胺氧化酶氧化形成。为哈尔满（Harman）形成的前体（→哈尔满生物碱）。5－羟基衍生物（5－羟色胺，5－HT）存在于哺乳类的血浆和两栖类的皮肤中，具有血管收缩作用。
5羟色胺又称血清素，它是色氨酸衍生而来的，它广泛存在于大脑、血小板和胃部等器官组织中。5羟色胺是中枢神经系统一种重要的抑制性神经递质，它在大脑皮层和神经突触内的含量是最高的。
