水体中碳源是否充足与总碱度中的碳酸根和碳酸氢根离子密切相关，而总碱度的高低也决定了水体的缓冲（稳定）能力，一般来说养殖水体的总碱度在80-200ppm为最佳，过高或过低都会对水体产生影响。
藻类光合作用时需要二氧化碳参与，因此水体中的碳源被不断消耗，如果不补充碳源，藻类因为缺乏碳源很容易老化。
此外，水土缺乏碳源，微生物（有益菌）缺乏能量，不能有效分解水体中的有机质，水体也就越来越脏。
