蛋白质的一级结构是空间结构的基础，有什么样的一级结构决定了蛋白质分子采取何种空间结构，但只有少数比较简单的蛋白质可以完成自我折叠，多数蛋白质需要分子伴侣的帮助才能形成正确的空间结构。
通常一级结构相似的蛋白质其空间结构和功能也相似，反之，功能相近的蛋白质往往具有相似的空间结构及一级结构
