反硝化细菌效果会受到很多因素影响比如温度、PH、溶解氧、有机碳源等
反硝化细菌的适宜生长温度为20~40℃，低于15℃，反硝化速率明显降低，冬季低温，需要保持一定的反硝化速率，需要提供污泥停留时间、降低负荷或提高污水的停留时间。
需要保持严格的缺氧状态，氧化还原电位-110~-50mV，反硝化反应才能正常进行，悬浮型活性污泥系统中溶解氧应保持在0.2mg/L以下，附着型生物处理系统可以容许较高的溶解氧浓度（一般低于1mg/L以下）。
