京东小金库和小金存区别在于性质不同。
京东小金库是京东为用户推出的资产增值服务，用户将钱转入京东小金库中即可购买理财产品或是在京东商城消费等。而小金存是一只短债基金，用户可以通过京东金融，使用京东小金库中的资金申购该基金。
