纯合子不会由于自交而分离出具有不同遗传因子的个体，因此，育种材料总是纯合的，保持其性状不变。杂合子自交可以得到纯合子。
纯合子分为两类：显性纯合子和隐形纯合子 。
显性纯合子是 指同源染色体上两个显性等位基因型完全相同的个体，全部用大写字母表示，如AA和AABB。隐形纯合子是 指同源染色体上两个隐性等位基因型完全相同的个体，全部用小写字母表示，如aa和aabb。
