1、科目不同：虹鳟鱼是鲑科、太平洋鲑属的一种鲑鱼，而菜鲟属硬骨鱼纲、鲑形目、鲑属的一种淡水鱼。
2、食用方式不同：虹鳟鱼可以用来炖食、煮粥，而菜鲟通常是生吃、做寿司、煎食、炖汤、炖粥等。
3、颜色不同：虹鳟鱼的身上有一条长长的红线，肉的颜色较浅，脂肪线条纹窄且不明显，菜鲟的颜色鲜亮，脂肪线条纹宽而且很明显。
