两者区别主要是：级别不同，职责不同。
小学副校长是校级领导，开校长办公会要参加，其考察任免是上级教育行政部门，是教导主任的上级分管领导。
教导主任是学校中层领导，具体负责教导事务，如教学研究、教师培训、学生考试、转学事宜等，其考察任免主要在学校，是教导事务的具体经办者，属于部门领导。
