加盟与直营连锁的区别如下：
区别1、产权关系不同。加盟是独立主体之间的合同关系，各个特许加盟店的资本是相互独立的，与总部之间没有资产纽带；直营连锁属于同一资本所有，各个连锁店由总部所有并直接运营、集中管理。
区别2、法律关系不同。加盟连锁（特许连锁）中特许人（总部）和被特许人（加盟店）之间的关系是合同关系，双方通过订立特许经营合同建立起关系，并通过合同明确各自的权利和义务。而直营连锁中总部与分店之间的关系则由内部管理制度进行调整。
区别3、管理模式不同。加盟连锁的核心是特许经营权的转让，特许人是转让方，被特许人是接受方，特许经营体系是通过特许者与被特许者签订特许经营合同形成的。直营连锁经营中，总部对各分店拥有所有权，对分店经营中的各项具体事务均有决定权。
区别4、涉及的经营领域不完全相同。直营连锁的范围一般限于商业和服务业，而加盟连锁（特许连锁）的范围则宽广得多，除商业、零售业、服务业、餐饮业、制造业、高科技信息产业等领域外，在制造业也被广泛应用。
参考资料来源：百度百科-直营
百度百科-连锁加盟
连锁店是统一配货的，旗舰店是官方的龙头店面。连锁：统一采购，统一配送、统一标识、统一营销策略、统一价格、统一核算加盟：有一家总部，提供货源。更新产品适应市场、提供指导和帮助。旗舰店首先要搞清楚“旗舰”的含义。旗舰是一些国家的海军舰队司令、编队司令所驻的军舰，因舰上挂有司令旗，故叫“旗舰”。旗舰店是竞争加剧的市场经济时代的产物，对促进连锁经营、树立品牌形象均大有益处，而且也是企业拓展市场份额的有效手段。旗舰的英文翻译是ultimate,即终极的,根本的,极限的,最后的。在当今日趋激烈的竞争环境里，市场机会对于小资本的独立创业者来说已是越来越少。
