刚煮熟的芋圆如果要长期保存的话，可以放入冷水中冷却，然后将芋圆分别放入冰箱的冷冻室进行速冻，再将冷冻好的芋圆一起放入保鲜盒中，密封保鲜， 并放入冰箱冷冻保存。
如果要在短时间内食用，最好配上汤，用碗、锅、保鲜膜或盖子密封。然后放入冰冷藏。一定要防止在冷藏过程中水分蒸发，如果芋圆缩水，会变硬粘在一起，可能会影响二次食用。而且需要注意的是，煮熟的芋圆最多只能冷藏三四天，不宜存放太久，因为时间长了不仅会失去味道和风味，还会产生各种细菌。
