柠檬品质问题
柠檬性平，味甘、酸，本身应该是酸、甜的口味，但是有些柠檬因为品种问题，本身苦味素较重，因此用这种本身苦味较重的柠檬冲泡蜂蜜柠檬水，会有一种怎么也掩盖不了的苦味。因此泡蜂蜜柠檬水的时候要选择品质较好的柠檬。
水温过高
1. 柠檬中不仅含有苦味素，柠檬皮中还含有苦味的橙皮苷，橙皮苷在高温的水中溶出较多，因此泡蜂蜜柠檬水的水温越高，苦味会比较重。
2. 蜂蜜中的主要甜味来自于果糖，而果糖温度越高，甜味越淡，温度越低，甜味越重，因此不用温度过高的水冲泡蜂蜜柠檬水。
柠檬籽没有去除
柠檬籽中苦味素和橙皮苷蓄积较多，泡蜂蜜柠檬水的时候如果没有将柠檬籽去除，其苦味成分会溶解在水中，出现味道很苦的情况。
浸泡时间过久
即使是苦味较淡的柠檬，长时间的浸泡也会导致苦味成分溶出较多，使蜂蜜柠檬水中带有丝丝的苦味，不过这种苦味较淡，通常比柠檬品质不好而导致的苦味弱很多。
