藿香正气水和藿香正气口服液都有解表化湿、理气和中的功效，然而其不同之处在于藿香正气水采取乙醇渗漉法和水煎煮法制取，浸出制剂的乙醇量约40%-50%，性味辛苦。而藿香正气口服液采取加水回流蒸馏法和水煎煮法，浸出制剂不含乙醇。
而且藿香正气水由水煮及酒浸制而成，疗效最明显，但口感较差，也正是因为霍香正气水药效比较峻猛，小儿和年老体虚者服用时应有医生指导服用，而藿香正气口服液是藿香正气水的换代产品，不含酒精，口感好，对肠胃无刺激，适合老人、妇女及儿童服用。
