1. 注意温度和明火：纯过氧乙酸极不稳定，在-20℃时就会发生猛烈爆炸，如遇明火或高温易发生自燃、燃烧或爆炸。
2. 应急处理：一旦有过氧乙酸消毒液溅到皮肤上或眼睛里，应当立即用流动的清水冲洗，以免造成烧伤。
3. 不可用于地面消毒：过氧乙酸对大理石和水磨石等材料地面有明显损坏作用，切忌用其水溶液擦拭地面。
4. 防止腐蚀和损伤：使用过氧乙酸时应防止损坏物品，不得用于精密仪器和锋利的器械消毒，擦拭消毒后立即用水擦洗干净。生产操作者要采取防护措施，如防护眼镜、防护手套、防护鞋等，以防止沾染到皮肤上造成损伤。
5. 确保使用浓度：过氧乙酸不稳定，配制时要保证浓度，随时使用随时配制，防止过期使用。应严格按照所购入的过氧乙酸消毒液的浓度和使用说明进行调制，在不知确切浓度时，使用前应用消定法或专用试纸测试浓度。不能过高，也不能过低。
