1、基因决定
先天性的异瞳是由全白或加白基因引起的，如果加白基因正好侵袭到了控制眼色素基因的位置，就会形成蓝色的眼睛，另一只眼睛没有侵袭到的话就是黄色的眼睛，如波斯猫常见异瞳、白色毛发的猫咪常见异瞳。这种异常虽然对猫咪的健康和听力没有影响，但存在异瞳的猫咪通常都会有听力方面的障碍。
2.后天病变
如果猫的眼睛颜色以前是一样的，也可能是因为疾病、受伤和其他原因影响眼睛虹膜色素细胞的产生，从而改变了眼睛的原始颜色。如果是这样，宠物主人最好带猫去宠物医院检查，看看具体原因是什么，然后进行有针对性的治疗。
注：约75%的不同瞳孔的猫蓝眼睛的耳朵听不到声音，但关键颜色引起的眼睛蓝耳朵正常，如金点、银点等猫。
