小猫打干扰素的副作用，可能使猫咪发生一过性疲劳、高烧、呕吐及其腹泻症状，尤其是给猫咪静脉输液干扰素时，副作用会更大一些。干扰素属于抗病毒的药物，针对于猫咪的病毒性感染。
猫咪感染病毒之后，有可能出现白细胞、血小板及其血细胞等一定程度的降低，干扰素能够有效的提升病毒性疾病的治疗率，可是也可能会影响猫咪肝酶浓度，使肝脏的检验指标提升，部分干扰素还可能对猫咪的双眼有刺激性。小猫注入干扰素必须带到宠物诊所，依照公斤体重服药，干扰素主要用于猫咪的病毒性感染，尤其是猫瘟引起的病毒性肠炎，疱疹病毒引起的鼻支，及其新冠病毒变异引起的传腹等应用比较常见。
猫咪假如身患病毒性肠炎时，除干扰素之外，还要给猫咪补充体液和电解质，改正猫咪的脱水情况。对于有呕吐、腹泻及其便血的猫咪，必须对症用药医治改进猫咪的病症。
