1.一般情况下企业如果不开发票，但是依法申报了未开票收入，税务机关一般不会对企业不开发票的行为进行处罚。除非公司不开发票，购买方要求开具发票，销售方拒绝开具发票，购买方向税务机关进行了投诉。
2.税务机关发现公司不开具发票这种问题的渠道很多，具体来讲，主要有以下渠道：
一是购买方投诉，货物劳务或者服务提供方不开具发票。
二是纳税人成本收入倒挂，存在明显隐瞒收入的问题，可能存在大量收入没有开具发票。
三是纳税人或者关联企业内部知情人士因为各种原因举报。
四是其他偷逃国家税款案件查处发现的问题线索。
五是纳税人投入产出明显不配比。如果纳税人购进了大量原材料、电力等，但是产出明显与投入不配比，可能存在大量未开票收入没有申报。
3.随着税收征管信息化建设的不断推进，通过通过不开发票隐瞒收入的问题税务机关的监控手段会越来越科学和精准。如果大量隐瞒收入是很容易被发现和识别，建议这种做法一定要三思而后行。
