Docker PBS 是一种基于 Docker 构建的分布式计算系统。它能够很好地管理和分配计算任务,提高计算效率,同时还能使计算资源的利用率更高。
# Docker PBS 的安装1. 下载并安装 Docker2. 安装 PBS 的 Docker 镜像docker pull kaixhin/pbs3. 创建 PBS 集群的 Docker 容器docker run --name pbs_mom1 -h pbs_mom1 -d -P kaixhin/pbsdocker run --name pbs_server -h pbs_server -d --net=host kaixhin/pbs
在 Docker PBS 中,计算任务是通过脚本提交到集群的。下面是一个简单的 PBS 脚本示例。
# PBS 脚本示例#!/bin/bash#PBS -N myjob#PBS -l nodes=2:ppn=8,walltime=01:00:00#PBS -q batch#PBS -o myjob_output.log#PBS -e myjob_error.logcd $PBS_O_WORKDIRmpicc -o myjob myjob.cmpirun -np 16 ./myjob
这个脚本指定了任务的名称、所需要的节点数量和每个节点上的计算核心数量、运行时间、任务队列、以及标准输出和错误输出文件的名称。脚本中的计算任务使用了 MPI 并行编程框架运行。
当 PBS 脚本被提交到 PBS 集群时,Docker PBS 系统会自动分配计算资源,并管理整个计算过程。计算任务完成后,Docker PBS 会将计算结果输出到指定的输出文件中。